Πρακτικά ο βελονισμός δεν έχει ανεπιθύμητες παρενέργειες. Μερικές ήπιες δερματικές ενοχλήσεις (μώλωπας, κοκκίνισμα) υποχωρούν γρήγορα. Τυχόν έξαρση, όπου παρατηρείται μια προσωρινή επιδείνωση συμπτωμάτων, είναι ένδειξη επιτυχούς αντιμετώπισης. Το “ξέσπασμα” του οργανισμού είναι αποτέλεσμα επιτάχυνσης της επιθυμητής βελτίωσης και της επερχόμενης ισορροπίας.